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美國CIA的秘密計畫.有一組人馬(愛德華諾頓 飾演Eric Byer國安主管)專門負責透過藥物來改造特工的計畫，其各個計畫改造的特工依照不同成效，交給不同的國家機構使用。

絆腳石(Treadstone)是第一代試驗體，也就是1-3集主角Jason傑森包恩(麥特戴蒙 飾演)所屬的計畫，其改造的特工，精神上不穩定因素比較高，不適合長期偽裝偵查，所以給了CIA做政治暗殺，CIA給政治暗殺行動的代號是黑薔薇 (Blackbrair)，且絆腳石和黑薔薇的探員大概都必須承受副作用必須服藥(包恩第一集的頭痛)，但包恩已經有三年多沒服藥竟然還活著(可見其他沒吃藥的大該都死光了)，所以愛德華的手下才會那麼驚訝，甚至想把包恩搞回去做進一步檢查。

成果計畫(Outcome)試驗體則克服了精神不穩定的弱點，但是似乎情緒波動比較大，大概是第二代，給了軍方情報部做敵後滲透，第4集主角Aaron亞倫(杰瑞米雷納 飾演)所屬之計畫，成果計畫和其他衍生計畫室已經解決副作用的問題，只是幹員必須持續服用感知藥物以方便被操控，也因此這一代的探員不需要被洗腦，因為正常來說，停用藥物一陣子後就會開始失智，不需要靠洗腦來維護忠誠。

百靈鳥(Larx)是第三代，精神上比絆腳石(Treadstone)穩定，情緒上比成果計畫(Outcome)穩定，是目前為止最完美的試驗體。並移除幹員不必要的情感、同理心，成為完全被操控的機器，所以第四集的負責追殺主角的探員根本不管百姓的死活。

前三集中CIA的官員公器私用，利用Jason掩蓋自己貪污，逼反了Jason，造成絆腳石(Treadstone) 和黑薔薇 (Blackbrair)曝光，還在檔案裏留下了線索將絆腳石(Treadstone)聯繫到成果計畫(Outcome)，為了阻止整個組織作業曝光，諾頓才決定掐斷所有線索，把Outcome相關的機構人員統統殺掉，而Larx因為又是另一組人且沒有與Outcome的關聯，所以才沒動。

目前FBI的調查只是針對Blackbrair而已，對CIA的指責在於政治暗殺，以及Blackbrair不需要任何授權即可下令殺死任何人這一點，潘蜜拉(Pamela，CIA主管，是少數CIA長官中正義的一方)覺得這個計畫，給的權力太大了，事實也證明如此，因為有這個權力，所以CIA的官員一看搞不定了就下令清除所有相關人員，這樣下去就沒底了，變成想殺誰就殺誰。雖然說Treadstone都是自願加入試驗的，但是他們是為了報國，他們不問問題就清除目標，不是因為他們不在乎對錯，而是因為他們同意加入的時候同時選擇了相信他們的上級不會濫用權力利用自己為所欲為，Jason的上級背叛了這種信任。第一部結尾，Jason只是表示他不想再殺人了，感覺除了失憶以外就是精神上不穩定造成的，第二部就是揭露Jason的上級假公濟私，進而引出第三部徹底全盤崩潰。